GEOMETRIE des MOLECULES

Il s'agit de fournir les coordonnées spatiales d'atomes constituant quelques molécules de Chimie 
organique.

PRINCIPE
 Situer chaqu'atome par sa distance et ses angles vis à vis des autres, dans un repère trirectangle.
 Déterminer la structure plane comportant le plus grand nombre d'atomes possible.
 Placer ceux-ci dans le plan XOY et calculer à Z=0 les coordonnées de ces atomes compte-tenu de la 
distance interatomique et des angles valenciels donnés.

Distances connues en pm             		angles

 C-H   	109                         		H-C-H 	109°21' tétraèdre
 O-H 		96                          		H-O-C 	109°
 C-C   	154                        		H-N-H 	107°
 C-O   	140 (alcool) ou 133 (acide)
 C=C  	140 (aromatique) ou 134
 C=O 		122 (cétone, acide)
 C   C 	124
 N-H  	101
 Cl-H 	127

EXEMPLE
Calculer la position des atomes d'hydrogène de la molécule de méthane
Situer H1,H2,H3  dans le plan avec C1 à l'origine (0,0,0) après l'avoir situé au centre de 
gravité du tétraèdre (triangle équilatéraux) et donc au 2/3 de la hauteur 
alors que l'origine est tout d'abord O. Exprimer la coordonnée x de H1 puis H2 et H3 etc....
sachant 	H1H2=(2x[1.092 -1.092cos109°21'])0,5=1,77 et OH1=1,77x0866x2/3=1.02
C1      	0.00	0.0   	 0.000  	Exemple pour la lecture normalisée des fichiers
H1     	1.02  	0.0  	-0.501	Le format des colonnes est impératif ; respecter 2 espaces avant 
H3      	0.00	0.0   	 1.090	chaque atome et chaque coordonnée.
H2		?
H4		?

C1-H1          			Les liaisons existantes entre les divers
C1-H2         			atomes sont à expliciter.  (  ou H1-C1-H2 suffit)
Position de H3 coïncidant avec l'axe OZ (1.0900) ou [centre O] 1.09x(4/3) alors que H2 est déjà avec une coordonnée 
négative sur OX (-1..02x1/2) dans l'unité atomique 1A=10-10m etc..



RECHERCHES
THEME 1

Placer vos coordonnées dans un fichier par un éditeur de texte du type AZ (JM Forgeas)
puis lancer "Petitchimiste" et ouvrir votre fichier de la molécule en cliquant sur celui-ci. Vérifier la géométrie, par:
	a- L'aspect en rotation automatique	b- Les distances interatomiques	c-Les angles valenciels.

THEME 2
Charger les fichiers existants et déterminer pour chaque molécule le maximum d'atomes plan.
Schématiser les formules développées des molécules présentes en représentant les doubles et triples liaisons 
en notation de Lewis entre les divers atomes (d'après les distances et angles valenciels)